PCR實驗室，已逐漸成為檢驗領域必不可少的一部分，原則上臨床基因擴增檢驗實驗室應當設置以下區(qū)域：試劑儲存和準備區(qū)、標本制備區(qū)、擴增區(qū)、擴增產(chǎn)物分析區(qū)。這4個區(qū)域在物理空間上必須是完全相互獨立的，各區(qū)域無論是在空間上還是在使用中，應當始終處于完全的分隔狀態(tài)，不能有空氣的直接相通。

試劑貯存和準備區(qū)：主要用于貯存試劑的制備、分裝，該區(qū)域的面積通常在15~20平方米左右。

標本制備區(qū)：主要用于核酸提取、貯存及其加入至擴增反應管。該區(qū)域應符合生物安全二級。區(qū)域面積大約也在15~20平方米左右。

擴增區(qū)：該區(qū)域的面積通常在15~20平方米左右。

擴增產(chǎn)物分析區(qū)：主要用于擴增片段的進一步分析測定。

同時，PCR實驗室的空氣流向要按照試劑存儲和準備區(qū)流向標本制備區(qū)，再流向擴增區(qū)、擴增產(chǎn)物分析區(qū)的順序進行，以防止擴增產(chǎn)物從空氣氣流流入擴增前的區(qū)域。